Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC10.67□□□□□ -0.7
UBE2V1Q13404 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms