Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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KCNMA1Q12791 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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KCNMA1Q12791 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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KCNMA1Q12791 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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KCNMA1Q12791 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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