Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBRQ0VD83 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms