Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NIPAL4Q0D2K0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPAL4Q0D2K0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms