Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CD300CQ08708 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms