Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms