Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDK18Q07002 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK18Q07002 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK18Q07002 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK18Q07002 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDK18Q07002 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms