Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PSME1Q06323 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms