Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms