Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMF1P82094 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms