Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RPL23P62829 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms