Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms