Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
LOXL3P58215 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms