Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPFP49454 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPFP49454 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CENPFP49454 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms