Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDF5P43026 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDF5P43026 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDF5P43026 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms