Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms