Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMPD1P23109 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMPD1P23109 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms