Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
NTF3P20783 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NTF3P20783 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NTF3P20783 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
NTF3P20783 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
NTF3P20783 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NTF3P20783 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms