Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms