Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRATO95237 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRATO95237 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRATO95237 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRATO95237 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRATO95237 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRATO95237 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRATO95237 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LRATO95237 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRATO95237 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms