Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBDO15205 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBDO15205 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBDO15205 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBDO15205 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBDO15205 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
UBDO15205 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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UBDO15205 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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UBDO15205 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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UBDO15205 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
UBDO15205 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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