Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
UBXN8O00124 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms