Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E9PBE3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E9PBE3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
E9PBE3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms