Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SMIM1B2RUZ4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms