Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAXBP1Q9Y5B6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAXBP1Q9Y5B6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms