Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms