Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BRPF3Q9ULD4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms