Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MLH3Q9UHC1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms