Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CGGBP1Q9UFW8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CGGBP1Q9UFW8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CGGBP1Q9UFW8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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