Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RNF7Q9UBF6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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RNF7Q9UBF6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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