Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNMT3BQ9UBC3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNMT3BQ9UBC3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms