Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMBRD1Q9NUN5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms