Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ASCL3Q9NQ33 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ASCL3Q9NQ33 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms