Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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