Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms