Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
IFT27Q9BW83 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms