Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CRYGB-201ENST00000260988 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM106CQ9BVX2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms