Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
KCNS3Q9BQ31 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms