Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NPAS2Q99743 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPAS2Q99743 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms