Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms