Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS6KC1Q96S38 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms