Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPR78Q96P69 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms