Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MYO18B-201ENST00000335473 8565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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COPS9Q8WXC6 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PCNX2-203ENST00000344698 5348 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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COPS9Q8WXC6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
COPS9Q8WXC6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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