Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCER1Q8TC90 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms