Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KCNMB4Q86W47 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KCNMB4Q86W47 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms