Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDZD4Q76G19 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms