Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZBED9Q6R2W3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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