Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LETMD1Q6P1Q0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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