Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUT3

MFSD12, Major facilitator superfamily domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD12Q6NUT3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
MFSD12Q6NUT3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms