Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ANKRD40Q6AI12 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms